La administración de la Tercera Compañía Volante era responsabilidad del gobierno del Nuevo Santander, lo asumió el gobernador Vicente González de Santianas para impedir el ingreso de los apaches desde las provincias de Coahuila y Nuevo Reino de León. Para 1776, en Laredo, se formó una comandancia de las Provincias Internas.
Un año antes, el teniente Idelfonso de la Garza ocupaba el cargo de comandante militar y estaban los destacamentos temporales provenientes de las Villas de Reynosa, Camargo, Mier y Revilla como apoyo para su resguardo, exploraciones o vigilancia.
Encabezó Laredo, Texas, combate a apaches
La comandancia de las Provincias Internas unificaría los esfuerzos militares en todo el norte de la Nueva España, tuvo continuas jurisdicciones y cambios en su estructura, la colonia del Nuevo Santander dependió por un tiempo de esta estructura militar.
En la época también llegó a estar presente en esta población un jefe militar peninsular de alto rango, el capitán Claudio Lacomba, que en 1786 era comandante militar y autoridad política de Laredo.
En 1791 fue nombrado Ramón Díaz de Bustamante y Barroterán como comandante de la Tercera Compañía Volante, su mando duró hasta 1813 cuando pasó a asumir el gobierno del Nuevo Reino de León.
Ramón Castro titular de la comandancia de las Provincias Internas, realizó una inspección en Laredo al que encontró mal por los constantes ataques de los indios, la colonia del Nuevo Santander y el Nuevo Reino de León fueron sustraídos de la comandancia de las Provincias Internas.
Pasaron a depender de la autoridad directa del virrey con un jefe situado en San Luis Potosí, que era la cabecera de la intendencia, creada en 1786, al final de la administración fiscal de las llamadas Provincias Internas de Oriente, se componía de Coahuila, Texas, Nuevo Reino de León y el Nuevo Santander.
Virrey Calleja declaró la guerra a los indios
El teniente coronel del ejército español, Félix María Calleja del Rey, fue comisionado por el virrey Miguel de la Grúa Talamanca de Carini y Branciforte, 1 Marqués de Branciforte (1794-1798), para realizar informes del estado temporal de las misiones en las Provincias Internas.
Realizó una visita de inspección en 1794 a estas provincias y recomendó declarar la guerra a los indios de las praderas que se habían convertido en una amenaza constante para los asentamientos españoles.
Calleja reorganizó los destacamentos militares de la región para la defensa en la zona norte antes de convertirse en comandante de San Luis Potosí.